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众人开始沉默，等待胜利的消息。在冥王星解体的那一刻。许许多多的碎片和赤红的火球。在冰冷的宇宙中显得那么耀眼。
“看呐，那星球在闪烁，啊，火球在翻滚，死亡的星球吗？太令人感到惊叹了，觉得旁边的那飞行器不堪一击。他应该已经死了吧？……”
当许多人以为战争胜利了，各个都欢呼雀跃，载歌载舞。是战争哪有人类想象的那么容易，还只是个开始。
然而意想不到的是，星球爆炸的那一刻，士兵们却看到令人瞠目结舌的场景，被击溃的探测器却重新组合在了一起，时间也被重置，就连被摧毁的冥王星也再次浮现出原来的模样，时间竟被倒流了，探测器又“复活”了吗？
好多人心里在疑问。
潘教授在思考在琢磨，只找不到答案的方法，在寻思了好久才明白，恍然间，罪魁祸首明显就是这些超体们，难道它们被支配了？这些超级人类可是人类中最后的希望啊，他们背叛了人类。
而末日审判者在隐蔽空间看了看，在查询资料后，原来支配者也已经掌握了时间逆转技术，它们比过往的那些尼比鲁斯人更加强大，而战争的胜利也在反反复复无数次被修改，时间已经被“支配者”操控。他们还是在时空的角落重新复活潘多拉星。努力复原过去的那个属于他们支配者的宇宙。俩个尼比鲁斯神，复活了。
观察到这一切的陆毅行立刻就知道其中的缘故，因为他自从中了外星病毒（并不是病毒，只是类似细菌的意识体）后，那些外宇宙的空间技术，他也常常偷听，他能够感知这些外星病毒正在与异化者进行传递信息，潜藏在星际部队人中的埃博病毒悄然苏醒，他们隐藏的很深，同样是超体的陆毅行，在拥有强大的感知能力后，用超感知能力感受到，一阵阵电波正在向部分超体进行操纵，显然这些超体也是可以控制时间的，有些超体甚至能控制物体的移动轨迹，支配者们正是在利用这些超体人类能力控制未来的走向，他们正在与尼比鲁斯人在幻境中控制整个战局，这种幻境很难被发现，只有第九感知才能感知它们的存在！
而拥有无数超体能力的姜宁此刻也明白了他隐藏的目的和任务，他乘太空艇飞往地下神秘基地，寻找被支配者控制的超级人类，杀掉这些异能者。
这些超体被感染后，成立了反叛军，他们外表与人类无异，但潜伏在人类社会成为最主要的威胁之一，就连秘书长也是感染者之一，他被异化后，吸食史蒂夫超体女儿的血液，成为变异的究极体形态，屠杀破坏宇宙的时空轨迹，其他各个宇宙到处杀害自己的对手，造成时空混乱。他开始了去往平行宇宙屠杀这些反叛者。
为了杀掉这些反叛军，陆毅行用无数自己去往不同时空，斩杀不同时空中的藏匿的超体，他的目标明确，就是修复时空中的漏洞，杀掉这些异化超体。
……
在人类的舰队用人海战术不断击溃这些外星飞船后，时间也在不断流失，导致时空错乱，但流失的时间也被一点点修复，最后完全修改正确。姜宁回到他本体中的宇宙得意的大笑，发现超体们已经控制不了整个时间线的正常轨迹局面，导致他们已经失去了时空控制的能力。于是，姜宁通过时空错位进入到异界超体内部，发现了正在控制时空的超体们。于是时空战争也在开始虐杀。
另一边，主宇宙线的时空中，在尼比鲁人的帮助下，一些潜在被感染的敌人苏醒被控制，飞船开始叛乱对自己的飞船进行开火射击，大批航舰在不知情的情况下被Daoda
攻击，大批舰队被毁。第一批太空舰队灭亡之后，人类特殊军种开始对叛军进行追击，于是大批人工智能机器人对叛军进行自杀式袭击，人类的叛军也伤亡过半，显然已经开始挽回整个战争的局面，叛军还是向着探测器飞去，迎接他们的“主”获得更加强大的力量，连这些变异的究极体人类也同时回归到主宇宙的时空，参与这次最后的末日战争。
异变的究极体人类乘坐着太空飞艇，迎接尼比鲁斯人的探测器，它们华丽的黑色身躯，流线型的外形外套，黑色蚂蚁般的头盔，是太空军最为科幻级别的武器配置，普通的攻击是很难对它们有任何伤害。
当这些异化超体越过柯伊伯带，叛军部队第一次见到了尼比鲁斯人造的探测器，这也是他们首次接触外宇宙文明的探测器，一座黑色金字塔状，周围的空间被探测器扭曲成混乱的景象，这小小的探测器，它却有着宇宙中最先进的技术力量的结合，所以宇宙的科技力量的结晶，这小小的“黑色金字塔”超大质量竟让空间的扭曲变为多边形，像一个物体放在扭曲的水里，形状无规则，让外界的人永远无法摸清它真实的样子，幽灵来形容它是最恰当不过了，但它的技术却是整个宇宙的集合，周围的光也因为它自身强大的质量而被扭曲成弯曲的，像是无形的黑洞，在这个二号宇宙里显得格格不入，在超大质量的探测器面前，叛军的飞船像一张一桶就破的薄纸，这种至高无上的力量，让叛军们颤抖，叛军们都在热烈呼唤着他们心中的主，欢呼着他们心中的神。
探测器降落到一块巨大的陨石上，这颗巨大的陨石是被炸裂的冥王星残骸，他们汇集在一起进行仪式，许许多多的究极体人类都是超能力的异能者，他们都想看清楚“主”究竟是什么样子。
当超体人类见到如同神一般的文明从太空降临到地面时，歌颂着“神”的祷告，这颗金字塔状的探测器在静静观察着他们，许多叛军的飞船也向探测器的降临表达了善意的信号，它们在天空盘旋，组成恶魔的符合，以表示对他们崇高的敬意和忠心，他们的首领秘书长站在飞船的降落台上，衣着黑色燕尾服，但依旧保持着人类的身体，但头已经完全成为了恶魔，它默默与这个幽灵魔鬼鞠了鞠躬，期待着“主”的安排，也想获得更多可怕的力量。
然而这些外星舰队对他们的行为却不屑一顾，金字塔里周围空间开始变幻着周围的空间出现一串串植物，许许多多的异化人都进入到这个精神世界，这些植物白色透明，像一支蜗牛的眼睛抚摸着这个首领脸，首领得意着发出怪异的嘶叫，正在传达“主”给他带来的一切力量，他在幻境中表示愿意与主融为一体，在一番示意后，触角消失，幻境也消失了。他们并不理解“主”含义，但它们感知到一种可怕的力量正在吸取它们的超能力，之后迎接他们的将是比死亡还要可怕的深渊和绝望，他们的忠诚换来的却是灭顶之灾，首领站在甲板上，已经凝固成了白色液态般的“蜡像”，之后叛军的飞船被莫名的计算机病毒控制，所有飞船的程序出现乱码，大批飞船莫名其妙地停机熄火，仿佛让他们禁止靠近幽灵探测器。此时叛军们才清楚，这个魔鬼一般的探测器是来吃掉他们的，它们纷纷逃窜，醒悟的同时但以为时已晚。
探测器疯狂旋转，周围空间完全扭曲，它却以每秒三十多万公里以超越光速驰向叛军飞船反物质发动机，这些其他的叛军大部分还不清楚是怎么回事，眼巴巴的看着它疾驰而来，直接让叛军首领们究极体形态给撕了个粉碎，他们所敬仰的“主”并不把他们放在眼里，他们呆呆忘了许久才晃过神来，他们看着首领被直接干死却又无动于衷，却又不知所措，它们无处可逃，等待的只要死亡，此时的逃窜已经是多余的了，很快金字塔再一次冲向太空港口，这些太空中的一百多艏敌军战舰轮番被击穿，之后产生的巨大热核爆炸从第一排战舰开始蔓延，飞船船体被撕了一个大口子，在短短不到二十秒的时间，太空到处都爆发着炽热的核爆炸，那是反叛军的军舰，大爆炸所形成的钢铁暴雨在宇宙飞浅，太空仓被压扁的人体奔放出一朵血浆花蕾，形成一颗颗鲜血红宝石，探测器每次攻击都精确锁定飞船的反物质燃料仓，一艏艏飞船接二连三被摧毁，连地球联邦国际舰队的两千多艏太空军舰也都被波及，有些飞船的残骸撞击到另一艏战舰，太空军被乱作一团，天空布满了火焰的爆炸，而那些反叛者还在幻想着唉吼道：“主啊～你为什么抛弃我们！！”
“主”的目的只有一个消灭整个人类，连异变的超体对“主”来说都是一丝威胁，所以毁灭你与你无关！尼比鲁斯人此时已经开始对这些反叛者肆意的屠杀，丝毫不考虑另一种物种人类想的什么，灾难性的一幕上演了，太空反叛者在不到一分钟内全部被歼灭，他们的飞船如同燃烧的蜡烛瞬间融化，战场的规则完全被改写，毁灭它们的只是罗伊文明的一颗探测器，天空闪烁着爆炸所形成的热浪，那里的温度高达俩千万摄氏度，任何物体到了那里都会被热浪的翻滚所气化。在滚滚热浪中，那些人体完全被烧焦，飞船被撞碎。天空到处都是残缺的太空战舰。没有什么比这场战争更令人绝望，完全不是一个等级文明的技术压制。
而超体们也同样控制在时空走向，突然之间，终极AI过滤掉时空的出现的错误恢复到原有的时空，一颗探测器爆炸了，而姜宁也从空间漏洞拿着一“超体”头颅向天空炫耀，控制时空的超体被另一个超体人类干掉了，那个人头就是时间控制者，姜宁把他杀了，站在月球空间站上，显然在黑色金字塔明白其意，时间不会再被重置了，于是这个外宇宙武器大肆屠杀的，并注意姜宁的一举一动，黑色金字塔看到被利用主要超体死了，发狂地对大批舰队进行疯狂式摧毁，以证明他的威胁微不足道，黑色金字塔直奔姜宁。
各大星球被一颗小小型探测器撞破，太空到处都是残骸和星球碎块。太阳系舰队完全覆没。只剩下地球舰队主力军——人类之光。
约翰布莱恩看到这一幕，内心极其沉重，他面对能力永远无法探知的外星种族，虽说它们将所有的人类叛军一一剿灭，但约翰的心里依旧是痛的，因为他知道这些人虽然是傀儡，但毕竟还是被病毒控制的人，在面对如此复杂多变的战争，年迈的约翰决定亲自上阵，带领着四十多万的地球舰队军再次出发，浩浩荡荡的人类之光向着奥尔特星云迎击。引诱探测器转移注意力，也是保证超体姜宁能够活着。
在第一批舰队到达太阳系边界之后，舰队的飞船排列成巨大的C字型，包围整个外星舰队，因为胜利不再会被时间修改，舰队的目标是将敌人在包围圈内剿灭，之后留出空间将其余的飞船逃跑，然后利用其它智能机器人用自杀式爆炸袭击这些飞船，利用这些无人机轻便引到这些钢铁巨兽相撞，让它们自行灭亡，这样用最小的代价将其剿灭。
在地球国际飞船行驶在外太空的空间后，大批无人机部队也相序赶来，然而在对计划进行一半的时间后，尼比鲁斯人用超级纳米机器人已经悄悄侵入人类军舰的指挥系统，这些精密的系统和热信号传导装置直接被烧毁，燃烧之后，接触飞船里的氧气开始产生大爆炸。爆炸先是从一个太空舱传来，之后又烧毁了核聚变燃料室，很快里面的人被大火活活烧死，而其他星舰部队还不知发生了什么就瞬间被爆炸所产生的能量炸死，第一支全部阵亡，紧随其后第二支第三支……
约翰看到这一幕更加很意外且气愤，于是取消A计划执行B计划，约翰布莱恩全力对外星的军舰进行攻击，这时候探测器已经被引诱到木星附近，木卫二附近的飞船开始进行反击，那些能摧毁一颗星球的伽马射线炮对准“探测器”反复攻击，然而反复尝试击中后并对它没有丝毫损伤，而那些qi
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武器仿佛击中后完全稀释掉一般，反物质武器显然已经被太空舰队给用费了，而地球舰队一批又一批的战舰与这些外星舰队相序碰撞，以自杀式袭击撞击着这些外星舰队，大批飞船还是难逃摧毁的命运，显然这些计划完全不顶用，这也在计划之外的结果，在万分紧急的时刻，年迈的约翰已经顾不得自身的安全了，他关闭了与“终极AI”的联系，因为他是人类最后一道防线，不想让尼比鲁斯人发现最后的王牌，看着眼前的军舰一艘艘被摧毁，约翰陷入了沉思和苦痛，这是他的错误，而这个错误的责任由他自己负责，在几番流泪之后，此时约翰下达命令指挥让大批军舰前往木星，这是最短的距离，一批飞船调离到木星之后，大批飞船已经燃尽最后的燃料，有些飞船尾部还燃着烈烈火光。但探测器已经向他们赶来，约翰脸上微微一笑。
军官下达命令后，这些视死如归的战士们，将计划输入到大脑中，对约翰如此的信任，已经将生死置之度外，但都不明白其意。之后又一批部队前往木星，约翰布莱恩已经顾不得一切，这一切都是他领导的失职，他知道这一切都是他的错误造成的，责任驱使让他自己承担这一切的过错，他令敢死队将整个核聚变装置与他的飞船组合，之后全部调队离开，别人不知道他在做什么，只觉得指挥官在做正确的事，而约翰的心里也是暗中在着最后一搏，经过几番周折，年迈的军官约翰将大批外星飞船引到了木星最近距离，在观测完距离的数据之后，已经进入到了目的地，约翰冷冰冰的一笑对视这些恶魔。
黑色幽灵般的金字塔，射杀了许多攻击它的飞船，这些燃烧飞船集体转向撞击外星飞船，一些外星飞船也造到了重创。看到这一切，约翰觉得这些战士都是好样的，泪水不停的往地上滴。他觉着这一切的举动都是正确的，也是拿命赌的。
“魔鬼金字塔”首领追着人类大军的首领到离木星最近的地点，对这个首领进行赶尽杀绝，它还在发着恐怖的黑光，仿佛在嘲笑人类军官首领的愚蠢。
而约翰沉默不语，只是在火焰中疯狂的大笑……那种大笑是疯狂的，是震恨的、是走投无路誓死如归的。
潘教授问到：“约翰，你想干什么？”
此时约翰已经满脸血迹，捂着脸：“畜生们，人类的意志是不可战胜的，你们追了这么久，也该让你们就此结束了，就让你们见识一下人类的力量！啊哈哈哈，都给我死去吧！！”
潘教授突然醒悟到约翰为什么要这么做：“你这老家伙不想活了？！快离开木星，不然木星会变成第二个太阳的！”
“没关系，人类剩余的太空军还有时间逃脱！还有希望……”年迈的约翰微笑着，他启动最大功率向木星撞击，闭上了双眼……
巨大的战舰和核武器向木星前进，以光速的百分之九十的速度撞向了木星，这些外星飞船也紧随其后追杀着最后一支战舰，对最后一支军队首领赶尽杀绝，当战舰与木星接触之后高温产生的摩擦与木星氢气发生爆炸，约翰将可循环的氧气全部释放，剧烈的爆炸开始了，他流着泪，再次看着满天的火光“再见了，宝贝~”随后消失在了火海。木星开始剧烈的爆炸！！巨大的木星开始燃烧爆炸！整个星球成为巨大的火球！
显示器中闪着红色的字符：天启号飞船与木星相撞，天启号飞船信号消失……
潘教授眼里流出一些泪：“约翰！！人类会永远铭记你！！”
之后木星开始发生聚变反应，产生接二连三的巨大爆炸，这颗巨大的星球像一颗燃烧的火球。很快，第二个太阳爆发了，这种震惊的景象仿佛末日一般，它所产生的大爆炸一阵接着一阵，一批批先进的太空军舰完全融化，燃烧的烈焰波及整个尼比鲁斯人的飞船，剧烈的大爆炸还在继续，这颗巨大的木星发生了核聚变反应发生了剧烈的爆发，燃烧的烈焰将“黑色金字塔”吞没，大批小型外星飞船还没来得及逃脱就已经被木星的爆炸所摧毁！爆炸一阵接着一阵，木星此刻如同暴戾的太阳神，这种剧烈的燃烧一直持续了几十个小时。天空出现第二轮巨大的太阳！，胜利的曙光似乎这么到来了，但约翰布莱恩却永远牺牲了。
姜宁跪在地上，痴痴地望着天空。他知道约翰为什么这么做，不单单只是为了救最后一个超体，超体存在的意义也只有潘教授和约翰知道。约翰的脸颊映在太空永远的消失了。
“结束了！！我们终于胜利了！”潘教授眼睛闭着，眼睛开始默默流泪，这是他几个世纪以来第一次流泪，筹备了几个世纪就只为等待这一刻，他一下瘫坐到了指挥部位置上，许久都沉默不语。太多人死去了，太多人……
潘教授在信号还在播放画面的时候，看到四处到处都是飞船的废墟，和燃烧的残片，开始搜救尽可能幸存的飞船，在寻找幸存者的时候，看着这一幕，泪止不住的流了出来。但他依旧寻找幸存的飞船，他大声喊着：“结束了，孩子们，回家吧~”
那个声音在整个空间站回荡，反复诉说着胜利的消息，他将电波用信号搜寻着可能幸存的飞船时，有的飞船残肢断臂，缓慢地飞向地球，他感叹道还有幸存者…脸上有些喜悦……突然，看到燃烧的木星边上还有一块黑点游动，潘教授下意识的对黑点进行放大，然而“幽灵般的探测器”还在火焰中悬浮，“黑色金字塔”依旧顽强的在火焰中移动！
“这家伙还没死！！快跑啊，战士们！”潘教授此时陷入彻底绝望和崩溃“人类末日将近！！快跑啊！！战士们，你们不是它的对手！~”
此时黑色金字塔于两倍光速撞击了巨大的木星，直接撞向了最后一波仅存的飞船，尼比鲁斯人的科学技术已经可以改变人类认知物理世界的规律，他们技术已经初步改写了整个物理规律，甚至宇宙规律，这是几代宇宙文明智慧的结合体，这种飞行器以超越人类想象力速度奔向了最后一批残缺不齐星河战队，它可以实现空间跃迁，然而航迹所产生的热量瞬间点燃了木星上的氢气和氦，木星发生彻底的大爆炸，木星消失了！！摧毁的连渣都不剩。此时的魔鬼金字塔就像一个死神，
所到之处即是地狱，这颗星球连同它的卫星及大批量的飞船一同消失在了太阳系，人类的太空军全军覆没。整个人类的太空军在一颗探测器面前显得是那么不堪一击。生活在地球世界的人类彻底陷入低谷，很多人看到直播的这一切绝望地选择了自杀。
落日的余晖照耀在苍茫的大地上，幽灵死神睁开眼收割着人类的灵魂，人类那不可战胜的意志瞬间被罗伊星人的探测器所磨灭，飞船的残骸坠落在天际，像流星一样划过天空，人类大军曾是那样坚不可摧，不可一世，人类曾繁荣过，曾辉煌过，但这一切终将成为过去，绝望的眼泪在人们脸上滑落，化作点点繁星空中飘荡。人类的辉煌历史就此落幕，四千三百架飞船变成死寂一般的星际尘埃。
由于人类的最后防御圈的攻破了，人们被迫个个都选择离开太阳系，这种情况下出现了大批逃亡主义，以太空为首的星际联邦zhe
g府也无能为力，因为面对的不是宇宙级别的征战，只能选择逃亡，尼比鲁斯人开始清理地球上残存的人类，对人类进行血腥的屠杀，地球世界变得苍凉荒芜。
如今的地球已经变得廖无人烟，只有少数的机器人在挣扎和苟延残喘的活着。而逃走的外星飞船在太空飞行了不久就被一道道黑色激光射穿爆炸，所有的外星飞船遭到毁灭性打击，那竟然是第二颗“黑色金字塔”。
而超级AI也忽略了来自未知世界的金字塔，人类彻底绝望。
然而第二颗金字塔状探测器并不打算攻击摧毁地球，相反正当人类几乎绝望崩溃的时候，这颗探测器却以超越光速的速度撞击了破损黑色金字塔，它们相互纠缠，不断相互碰撞，人类以为这俩颗探测器发生了内讧，开始幸灾乐祸，俩颗探测器在数次不断撞击下，在经过最后一次大碰撞后竟然发生大爆炸，爆炸一直持续了很久，天空散落一片残骸，那个残骸上竟然有小艾画的笑脸，地球上一个小女孩看着这个残片，这才明白那蓝眼睛的外星人—高斯，对它们进行反击。
超界神发现了与之匹配的超体，原来姜宁一直就是高斯要找的古代超界神。
此时，天空中两个究极体，姜宁与高斯合体了，成为终极形态的超界神，他的能力显得比过去强大的多，在这次超时空大战中，他们的能力呈现指数级提高，他们不再是古代的超界神了，是最终形态。
与亚特兰蒂斯神族的合体，已经形成了超界神的所有能力，这种无穷无尽的能量，让他无限觉醒，他的蓝色眼睛变为了透明的玻璃色，整个躯体无形发出彩色变幻无穷的光，目光所到的地方，完全被戳穿，而藏匿在各个时空角落的支配者，知道上帝就是不生不灭的意识体，而上帝便是它们最终的组合体了，在醒悟过来后，超界体以无数黑色光的击穿下完全解体蒸发，宇宙空间被摧毁，这是末日审判者的审判……他既是创世之神，亦是毁灭之神。整个人类仿佛进入到了末日世界，亲眼目数了死神对恶意文明的直接毁灭，那些黑洞被击穿后蒸发，黑洞里的支配者也完全消失了，时间被修复了，但另一个时空却完全消失了。宇宙管辖执行的大神文明群体都来了，在天空呈现出绚烂的光。这便是绝对神的领域。黑暗的太空出现许许多多繁星流动的繁星，如同流星雨一般。大批量蓝色激光将整个星河染成了蓝紫色，这就是末日吗？直到最后的一切，一到蓝光射线照亮了地球，地球消失了……
之后他们消失了，所以人都被抹除了记忆，时间也回到了以往的平静，不在有战争和纷争。
粉碎的时空被修复了。3号宇宙消失了，2号宇宙成为主线宇宙
